Do imenovanja obnašao je dužnost apostolskog nuncija u Velikoj Britaniji. Na čelu Dikasterija za Istočne Crkve naslijedit će argentinskog kardinala Leonarda Sandrija koji službu napušta zbog navršene dobi. Primopredaja službe trebala bi biti u siječnju 2023. godine.

Nadbiskup Gugerotti diplomirao je istočne jezike i književnost te svetu liturgiju. Predavao je patristiku na Teološkom institutu San Zeno te teologiju i istočnu liturgiju na Institutu za ekumenske studije u Veroni, otkuda je i rodom. U Rimskoj kuriji radi od 1985., u Kongregaciji za Istočne Crkve, koje je podtajnik bio do 1997. godine. Također je predavao patristiku, armenski jezik i književnost na Papinskom orijentalnom institutu.

Rad u diplomaciji Svete Stolice, u službi apostolskog nuncija počinje obnašati 2001. do sadašnjeg imenovanja. Među ostalim, kao nuncij služio je u državama u kojima su Istočne Crkve značajno zastupljene – Gruziji, Armeniji, Azerbajdžanu, Bjelorusiji te Ukrajini.